Microsoft Research apresenta Quine para ligar modelos de biologia a experiências de laboratório
O sistema experimental combina dados de várias áreas da biologia e ferramentas científicas. A equipa relata testes iniciais de compostos em modelos laboratoriais de cancro pancreático.
A Microsoft Research apresentou Quine, um sistema experimental que procura ligar modelos de biologia a literatura científica, ferramentas de cálculo, investigadores e testes de laboratório. O objetivo é encurtar o percurso entre formular uma hipótese, selecionar experiências e usar os resultados para decidir o passo seguinte. Trata-se de tecnologia de investigação, não de uma ferramenta clínica.
A arquitetura proposta combina um modelo multimodal com uma camada que organiza tarefas e liga recursos. O modelo integra dados de genómica, proteínas, química, estados celulares e imagens biológicas. Em vez de analisar cada tipo de dado de forma inteiramente separada, a equipa procura representar relações entre escalas diferentes, das moléculas às células.
Um primeiro teste em investigação sobre cancro
Num projeto com investigadores do Broad Institute do MIT e de Harvard, a equipa usou Quine para priorizar compostos com potencial para alterar estados de células de cancro pancreático. Segundo a Microsoft Research, em ensaios com linhagens celulares, os compostos mais bem classificados produziram as maiores alterações pretendidas na passagem de um estado celular para outro. O modelo antecipou ainda a deslocação de algumas células para um terceiro estado, confirmada nos ensaios e geradora de novas hipóteses de investigação.
São resultados de modelos e ensaios de investigação. Não demonstram que exista um novo tratamento eficaz em pessoas, nem que o sistema possa tomar decisões médicas. A própria Microsoft assinala que as saídas podem estar incompletas ou erradas e exigem revisão por investigadores e validação experimental adequada.
O que distingue a proposta
O interesse editorial está no ciclo entre computador e laboratório: uma previsão sugere experiências, os resultados medidos podem corrigir a compreensão do problema e orientar a pergunta seguinte. A utilidade dessa abordagem fora dos exemplos apresentados terá de ser avaliada por mais equipas e em diferentes áreas da biologia.
A Microsoft abriu candidaturas para um programa de investigadores com acesso limitado ao sistema. Essa colaboração poderá ajudar a testar os seus limites, desde que o trabalho preserve supervisão humana e documentação dos resultados.
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